本试剂盒用于PCR扩增细菌16S rDNA,通过对PCR扩增产物DNA片段进行序列分析,可以鉴定所检细菌种类。16S rDNA其序列在物种间具有高度多样性,并由9个可变区和10个保守区组成。其中保守区反映了生物物种间的亲缘关系,而可变区则表明物种间的差异。因此,可利用保守区序列设计引物,将16S rDNA片段扩增出来,利用可变区序列的差异来对不同菌属、菌种的细菌进行分类鉴定。
细菌菌种鉴定
本试剂盒中包含进行细菌16S rDNA扩增的所有试剂,PCR扩增引物F/R1用于扩增细菌16S rDNA前500 bp的DNA 片段,F/R2用于全序列DNA片段的扩增。16S rDNA的前500 bp序列变化较大,包含有丰富的细菌种属的特异性信 息,进行DNA测序时一个测序反应即可测通,是一种较为便捷的16S rDNA鉴定方法;如果前500 bp序列不足以反映细菌的种属信息时,则可以进行16S rDNA的全序列PCR扩增及DNA测序,得到较为全面的16S rDNA序列信息。同时提供三条测序引物,包括正向测序引物Seq F,中间测序引物Seq I,以及反向测序引物Seq R。
2X Taq PCR Mix PCR primers: F (10 μM) R1 (10 μM) R2 (10 μM) Seq primers: Seq F (10 μM) Seq R (10 μM) Seq I (10 μM) Positive Control(1 ng/μL) Sterilized ddH2O
细菌基因组DNA样本
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