试剂盒中包括4种提取缓冲液，能够从细胞裂解物或组织的细胞质、细胞膜、细胞核，以及细胞骨架相关的蛋白质顺序隔离。

4种抽提试剂依次加入到细胞沉淀中并且离心分离出相应的片段（参见flowchart）。

另有组织样本实验流程可供选择，样本可在处理细胞沉淀操作前，用TissueRuptor在破碎的同时匀浆。

根据蛋白的亚细胞定位，对样本中的蛋白质进行分步抽提可以最大程度的富集低丰度蛋白。可用于研究酶、调控蛋白和结构蛋白的亚细胞定位情况；监测不同条件下蛋白在细胞内分布情况。