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应用于Illumina测序平台的Mate Pair文库构建
VAHTSTM Mate Pair Library Prep Kit for Illumina®
● 起始DNA量可低至1 μg - 4 μg
● 胶回收方案和非胶回收方案可供选择
● 更长的插入片段大小
● 仅需2天即可完成mate pair文库构建
● 更高的文库多样性和数据质量
图1. 建库流程示意图。
本试剂盒提供两种文库构建方案：非胶回收方案和胶回收方案。
在非胶回收方案中，仅需要低至1 ug的基因组DNA即可完成建库，得到插入片段长度分布2－15kb之间的高度序列多样性Mate Pair文库，广泛应用于小基因组de novo测序与组装。
对于复杂的基因组de novo测序，我们推荐使用胶回收建库方案。
胶回收方案是更具挑战性的建库方式，但是可以得到的更长的插入片段大小和更集中的片段大小分布范围的Mate Pair文库，非常适用于对于复杂基因组de novo测序的组装或者大片段变异检测。
使用胶回收方案一个样品可以通过选择1－3个胶回收片段范围构建多个文库来得到更多的信息。
图2. Agilent 2100 Bioanalyzer文库质量分析。
图3. 非胶回收方案制作的文库插入片段分布。
图4. 胶回收方案5－10 kb Mate Pair文库插入片段分布。
VAHTSTM Mate Pair Library Prep Kit for Illumina®是针对Illumina高通量测序平台文库构建定向优化而成的试剂盒。使用本试剂盒可以将DNA样品制备成Illumina高通量测序平台专用文库。Mate Pair文库是未知基因组测序的理想文库构建方案。 在大片段拼接，基因组完成组装以及结构变异检测方面发挥着不可替代的作用。
产品组分
VAHTSTM Mate Pair Library Prep Kit-Box1
| 组分 | ND104-01(48 rxn) |
| VAHTS Tagmentase | 192 µl |
| VAHTS Tagmentase Buffer(5×) | 1 ml |
| VAHTS Strand Displacement Ploymerase | 48 µl |
| VAHTS Strand Displacement Buffer (5×) | 500 µl |
| dNTP(10 mM each) | 48 µl |
| VAHTS Circulation Ligase | 336 µl |
| VAHTS Circulation Buffer(10×) | 1.5 ml |
| VAHTS Exonuclease | 288 µl |
| VAHTS Turbo End Prep Enzyme Mix | 144 µl |
| VAHTS Turbo End Prep Reaction Buffer (10×) | 312 µl |
| VAHTS Turbo T4 DNA Ligase | 96 µl |
| VAHTS Turbo Ligation Enhancer | 2×1 ml |
VAHTSTM Mate Pair Library Prep Kit-Box2
| 组分 | ND104-01(48 rxn) |
| VAHTS Adapter for Illumina (15 μM) | 120 µl |
| VAHTS Adapter for Illumina (15 μM) | 50 µl |
| VAHTS Index 2 Primer for Illumina (25 μM) | 50 µl |
| VAHTS Index 4 Primer for Illumina (25 μM) | 50 µl |
| VAHTS Index 5 Primer for Illumina (25 μM) | 50 µl |
| VAHTS Index 6 Primer for Illumina (25 μM) | 50 µl |
| VAHTS Index 7 Primer for Illumina (25 μM) | 50 µl |
| VAHTS Index 12 Primer for Illumina (25 μM) | 50 µl |
| VAHTS Index 13 Primer for Illumina (25 μM) | 50 µl |
| VAHTS Index 14 Primer for Illumina (25 μM) | 50 µl |
| VAHTS Index 15 Primer for Illumina (25 μM) | 50 µl |
| VAHTS Index 16 Primer for Illumina (25 μM) | 50 µl |
| VAHTS Index 18 Primer for Illumina (25 μM) | 50 µl |
| VAHTS Index 19 Primer for Illumina (25 μM) | 50 µl |
VAHTSTM Mate Pair Library Prep Kit-Box3
| 组分 | ND104-01(48 rxn) |
| Bead Bind Buffer | 20 ml |
| Bead Wash Buffer | 80 ml |
| Resuspension Buffer | 45 ml |
VAHTSTM Mate Pair Library Prep Kit-Box4
| 组分 | ND104-01(48 rxn) |
| VAHTS Super-Fidelity DNA Polymerse | 48 µl |
| VAHTS Super-Fidelity PCR Buffer(2×) | 1.2 ml |
贮藏与保质期
Box1，Box2和Box4 -20℃保存,Box3常温保存,所有成分有效期一年。
适用范围
大片段de novo组装和结构变异检测
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