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- 针对种属:human
- 质粒由来源于 GeCKO (v2)库的HLA-DQB120 nt向导RNA组成。
- 向导RNA指导Cas9蛋白去诱导基因组DNA中的位点专一的双链破裂(DSB)
- 基因的敲除或者激活可以使用 HLA-DQB1 Antibody (Genox 3.53): sc-53313分析
- 除慢病毒激活颗粒外,其他产品均为转染即用型纯化DNA质粒。慢病毒激活颗粒预包被成慢病毒颗粒的形式,适用于难被转染的细胞
CRISPR/Cas9 KO Plasmid
Description - 20 µg 纯化的即用型的质粒DNA,最多可供20次转染
- 为保证最大敲除效率,HLA-DQB1 CRISPR/Cas9 敲除质粒 (h2) 包含三个质粒,每个质粒都编码Cas9 核酶和 HLA-DQB1-特异性20nt向导RNA.
- gRNA 序列来源于 GeCKO (v2)文库,指导Cas9蛋白去诱导基因组DNA双链中一个特异位点的断裂。
- 为筛选出Cas9成功诱导的目的基因双链断裂的细胞,推荐使用HLA-DQB1HDR质粒(h2)(sc-403051-HDR-2)共转染
- 转染后,基因敲除效率可以用抗体:HLA-DQB1: sc-53313,通过WB, IF或者IHC分析
See Protocol Online. HDR Plasmid
Description - 20 µg 纯化的即用型的质粒DNA,最多可供20次转染
- 推荐用 HLA-DQB1 HDR 质粒 (h2) 和 HLA-DQB1 CRISPR/Cas9 KO 质粒 (h2) CRISPR/Cas9敲除质粒共转染 (h2)
- HLA-DQB1 HDR 质粒 (h2) 包含2-3种质粒,每一种都含有一个同源介导的双链DNA修复(HDR)模板,与 HLA-DQB1 CRISPR/Cas9 KO 质粒 (h2) 的剪切位点相对应
- 每个HDR质粒包含两个800个bp同源臂,可特异地结合到相应的Cas9诱导的双链DNA破坏位点附近的基因组DNA
- 每个HDR质粒中嵌入了一个嘌呤霉素抗性基因,从而能筛选出稳定敲除(KO)细胞,以及一个RFP(红色荧光蛋白)基因,可用于观察验证转染情况
- 嘌呤霉素抗性基因和红色荧光蛋白基因的两侧是两个LoxP位点,以便与接下来的Cre Vector sc-418923处理
See Protocol Online. Double Nickase Plasmids
Description - 20 µg 纯化的即用型的质粒DNA,最多可供20次转染
- HLA-DQB1 双切口酶质粒(h)含有一对质粒,分别编码D10A突变的Cas9核酸酶,和目标特异的 20 nt 向导RNA (gRNA),与其相应的HLA-DQB1 CRISPR/Cas9敲除质粒相比,它在基因敲除方面具有更好的特异性
- 成对的向导RNA序列与目标基因中约20个碱基对互补,从而使Cas9可以模仿DNA双链断裂(DSB),介导特异的基因组DNA双切割
- 质粒对中的一个包含供筛选使用的嘌呤霉素抗性基因;另一个包含供观察转染使用的绿色荧光蛋白标记
- HLA-DQB1双切口酶质粒(h2)编码的成对的向导RNA与HLA-DQB1双切口酶质粒(h)的编码的向导RNA不同
- 转染后,基因敲除效率可以用抗体:HLA-DQB1: sc-53313,通过WB, IF或者IHC分析
See Protocol Online. CRISPR Activation Plasmids
Description - 20 µg 纯化的即用型的质粒DNA,最多可供20次转染
- HLA-DQB1 CRISPER激活质粒(h)是一种协同激活介质(SAM)转录激活系统,目的在于特定上调基因表达
- HLA-DQB1 CRISPR激活质粒(h)包含三种质量比为1:1:1的质粒:一种质粒编码去活化的Cas9 (dCas9)核酸酶(D10A and N863A),它融合了转录活化域VP64和杀稻瘟菌素抗性基因;一种质粒编码MS2-p65-HSF1融合蛋白和潮霉素抗性基因;一种质粒编码目标特定的20 nt向导RNA和嘌呤霉素抗性基因
- 形成的SAM复合物结合到转录起始位点上游大约200-250 nt的特定位点区域,为高效激活基因提供转录因子的招募
- HLA-DQB1 CRISPR激活质粒(m2)中编码特异目标的 20 nt 向导RNA的单链 gRNA (MS2) 质粒不同于HLA-DQB1CRISPR激活质粒(h)的gRNA
- 转染后,基因激活效率可以用抗体:HLA-DQB1 Antibody (Genox 3.53): sc-53313,通过WB、IF或IHC分析
See Protocol Online. Lentiviral Activation Particles
Description - 200 µl 高滴度即用型CRISPR/dCas9慢病毒激活粒子
- HLA-DQB1 慢病毒激活颗粒(h)是一种协同激活介质(SAM)转录激活系统,通过细胞慢病毒转导,特异高效地上调目的基因的表达
- HLA-DQB1慢病毒激活颗粒(h)包含以下SAM激活元素:一种是去活化的Cas9 (dCas9)核酸酶(D10A and N863A),它融合了转录活化域VP64;一种是MS2-p65-HSF1融合蛋白;一种是目标特定的20 nt向导RNA。它们还含有杀稻瘟菌素,潮霉素和嘌呤霉素抗性基因
- 一经转导,形成的SAM复合物结合到转录起始位点上游大约200-250 nt的特定位点区域,为高效激活基因,招募转录因子
- HLA-DQB1 慢病毒激活颗粒(h2)中编码的特异目标的 20 nt 向导RNA的gRNA不同于HLA-DQB1慢病毒激活颗粒(h)中编码的gRNA
- 转染后,基因激活效率可以用抗体:HLA-DQB1 Antibody (Genox 3.53): sc-53313,通过WB、IF或IHC分析
See Protocol Online.